基于大量品系试验设计的QTL检测方法研究

【摘要】数量性状具有重要的经济价值,研究数量性状遗传位点(QTL)的分析方法具有重要意义。本研究利用两种试验设计控制试验误差,通过理论推导、模拟验证,统计功效评估,推理获得改进QTL检测精度的方法。主要结果如下：1)基于格子设计试验的QTL检测方法：格子设计能够解决大量品系试验的误差控制问题。本研究利用格子设计,构建了复合区间定位模型,提出了相应的QTL检测方法。通过模拟基因组、QTL效应、区组效应等,比较研究格子设计和完全随机区组设计下QTL检测精度。结果表明,与随机区组试验设计的QTL定位模型相比,格子设计QTL定位模型的QTL检测功效高,假发现率低。以大豆生物量性状的试验数据为实例分析结果,与以平均表型值作为响应变量的方法相比,利用格子设计检测QTL的方法可检测到更多QTL,这可能得益于有效控制了试验误差。2)基于重复内分纽设计试验的QTL检测方法：重复内分组设计也能够解决大量品系评估的试验误差控制问题。本研究基于重复内分组设计,构建了复合区间定位模型,提出了相应的QTL检测方法。通过模拟基因组、QTL效应、分组试验误差等条件,比较研究重复内分组设计和完全随机区组设计下的QTL检测精度。结果表明,与以随机区组试验平均表型值为响应变量的定位模型检测结果相比,采用重复内分组设计QTL检测模型,QTL检测功效更高,而且假发现率较低。总之,本研究基于格子设计和重复内分组设计,获得了相应的复合区间QTL检测模型。利用这些模型能够有效提高QTL检测精度。同时本研究也说明,控制试验误差对于提高QTL检测精度是非常重要的。
【作者】李纪杰；
【导师】管荣展；
【作者基本信息】南京农业大学，作物遗传育种，2013，硕士
【关键词】格子设计；重复内分组设计；QTL定位；功效；假发现率；

【参考文献】
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